MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhodococcus erythropolis PR4 plasmid pREL1

Total Repeats: 827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007491	GCC	2	6	54	59	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_007491	CGC	2	6	76	81	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_007491	AGG	2	6	1372	1377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007491	CGC	2	6	2657	2662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_007491	AGA	2	6	2709	2714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007491	TGAG	2	8	2725	2732	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007491	GCCG	2	8	6229	6236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007491	CCTG	2	8	6245	6252	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007491	CTG	2	6	6305	6310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007491	TTCATG	2	12	6317	6328	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_007491	ACG	2	6	7684	7689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007491	TCG	2	6	13043	13048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007491	ATCGA	2	10	13158	13167	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007491	CCGG	2	8	13177	13184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_007491	GCT	2	6	13565	13570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007491	CAA	2	6	13657	13662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007491	CAT	2	6	13674	13679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007491	CGGAG	2	10	13705	13714	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_007491	ACT	2	6	13741	13746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007491	TGG	2	6	13769	13774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007491	G	6	6	13780	13785	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007491	CAG	2	6	13798	13803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007491	GCC	2	6	13948	13953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_007491	CAG	2	6	13979	13984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007491	CTC	2	6	14011	14016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_007491	CG	3	6	15926	15931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007491	GAA	2	6	15969	15974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007491	ATG	2	6	15984	15989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007491	TCT	2	6	16031	16036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007491	GAT	2	6	16173	16178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007491	GTGC	2	8	16179	16186	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_007491	TGCG	2	8	16200	16207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_007491	ACT	2	6	16355	16360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007491	GCTT	2	8	16382	16389	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_007491	CGA	2	6	17192	17197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007491	GCT	2	6	17230	17235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007491	CACT	2	8	17249	17256	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007491	TGA	2	6	17360	17365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007491	CGA	2	6	18223	18228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007491	CGA	2	6	18371	18376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007491	CGC	2	6	18409	18414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_007491	GCAG	2	8	18433	18440	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_007491	CGA	2	6	18492	18497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007491	GCG	2	6	18499	18504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007491	GCC	2	6	18548	18553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_007491	CG	3	6	18579	18584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_007491	GTG	2	6	18623	18628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007491	TGG	2	6	18640	18645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007491	AGT	2	6	18734	18739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007491	TGC	2	6	18786	18791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007491	GC	3	6	18790	18795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_007491	CGT	2	6	18825	18830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007491	GC	3	6	18837	18842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007491	CCAG	2	8	18848	18855	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007491	TGC	2	6	18892	18897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007491	CGCA	2	8	18905	18912	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007491	TCG	2	6	18927	18932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007491	CCG	2	6	18933	18938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_007491	GAC	2	6	18949	18954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007491	CTG	2	6	19014	19019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007491	CTCC	2	8	19048	19055	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_007491	TGC	2	6	19126	19131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007491	GGCA	2	8	19167	19174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_007491	GCA	2	6	19200	19205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007491	CTT	2	6	19221	19226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007491	TACCGA	2	12	19272	19283	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007491	CTG	2	6	20082	20087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007491	TG	3	6	20092	20097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007491	AGC	2	6	23289	23294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007491	TGTT	2	8	23317	23324	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007491	TGT	2	6	23342	23347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007491	TGT	2	6	23357	23362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007491	CAA	2	6	23432	23437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007491	A	6	6	23456	23461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007491	A	6	6	23467	23472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007491	AGG	2	6	23568	23573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007491	CG	3	6	25379	25384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007491	AGG	2	6	25417	25422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007491	ACC	2	6	25442	25447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_007491	CTC	2	6	25486	25491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_007491	CCG	2	6	26130	26135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_007491	GGCC	2	8	33447	33454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007491	ACG	2	6	33461	33466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007491	ATC	2	6	33482	33487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007491	ACC	2	6	33515	33520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_007491	CGA	2	6	33543	33548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007491	CG	3	6	33563	33568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_007491	TAC	2	6	34013	34018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007491	CG	3	6	34083	34088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007491	CTCCC	2	10	34100	34109	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
91	NC_007491	GTT	2	6	34170	34175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007491	GAC	2	6	34217	34222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007491	CGG	2	6	35024	35029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007491	TG	3	6	35044	35049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007491	TG	3	6	35083	35088	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007491	CG	3	6	35098	35103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_007491	AAC	2	6	35139	35144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007491	CTG	2	6	35277	35282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007491	AGC	2	6	35283	35288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007491	GA	3	6	35311	35316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007491	GTT	2	6	35431	35436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007491	GTG	2	6	35504	35509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007491	GA	4	8	35568	35575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007491	TTC	2	6	35577	35582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007491	AGA	2	6	35629	35634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007491	TGCGCG	2	12	35650	35661	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007491	AGG	2	6	35677	35682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007491	ATGCAG	2	12	35689	35700	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_007491	GCG	2	6	35853	35858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007491	AAT	2	6	39816	39821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007491	ATT	2	6	39837	39842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007491	CCCG	2	8	39910	39917	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_007491	GCC	2	6	39926	39931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_007491	TTTG	2	8	39944	39951	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007491	CA	3	6	39963	39968	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007491	GAG	2	6	40020	40025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007491	ACC	2	6	41001	41006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_007491	TAC	2	6	42622	42627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007491	CGT	2	6	43395	43400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007491	CGC	2	6	44071	44076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_007491	CA	3	6	45903	45908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_007491	CTG	2	6	45912	45917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007491	GGCA	2	8	45948	45955	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_007491	CAG	2	6	45968	45973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007491	GCG	2	6	46597	46602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007491	GCCA	2	8	46654	46661	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_007491	ACC	2	6	46727	46732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_007491	TTC	2	6	48296	48301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007491	CTTC	2	8	48311	48318	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007491	CAA	3	9	51664	51672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007491	AAG	2	6	51703	51708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007491	TCCAG	2	10	51728	51737	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_007491	GGA	2	6	52170	52175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007491	GTC	2	6	60866	60871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007491	TTGC	2	8	60883	60890	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_007491	GC	3	6	60895	60900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_007491	TTGCG	2	10	60901	60910	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_007491	AAG	2	6	61939	61944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007491	GGA	2	6	61992	61997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007491	GGGT	2	8	62005	62012	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007491	CGA	2	6	62825	62830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_007491	CGC	2	6	62987	62992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_007491	TGC	3	9	62993	63001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_007491	GC	3	6	63020	63025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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276	NC_007491	GAG	2	6	105373	105378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
277	NC_007491	GATC	2	8	109094	109101	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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441	NC_007491	GCCC	2	8	172482	172489	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
442	NC_007491	GC	3	6	172490	172495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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453	NC_007491	GTTG	2	8	173671	173678	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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457	NC_007491	AGCC	2	8	173877	173884	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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463	NC_007491	AG	3	6	174072	174077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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469	NC_007491	GC	3	6	174240	174245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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